生物安全柜屬于垂直層流臺，經過層流臺頂部的過濾器，可以過濾99.99%的0.3μm以上的微粒，使操作臺空間構成部分100級的潔凈環境，而且經過作業臺面四周的散流孔回風構成相對負壓，因而，不應當有任何物體阻撓散流孔，包含手臂等。

　　

　　雖然生物安全柜可以對使用者進行保護，其理論上是可以達到這樣的效果，在實際應用方面，具體的效果就與實驗者自身的操作有直接關系了。有些實驗者忽視了對這種設備的操作方法關注，在使用設備的時候忽視了對設備的認證、消毒、維修等，結果導致設備存在這樣那樣的問題，無法滿足使用者的需求，為其營造一個良好的環境。若是使用者對設備的細節問題不予關注，在使用這種設備的時候盲目進行，生物安全柜很容易會導致操作者在應用這種設備的時候受到細菌等感染，尤其是一些特殊的實驗之中，所使用的樣品感染性較強，一旦被感染就麻煩了。而很多方面的內容，都是在平常應用中都能夠避免的，只要是使用者嚴格的按照規定應用，就會讓自己受到不必要的影響。

　　

　　注意事項：

　　

　　1、緩慢移動原則：為了避免影響正常的風路狀態，柜內操作時手應該盡量平緩移動。物品平行擺放原則：為了避免物品和物品之間的交叉污染現象產生，在柜內擺放的物品應該盡量呈橫向一字擺開，避免回風過程中造成交叉污染。同時避免堵塞背部回風隔柵影響正常風路。

　　

　　2、避免震動原則：柜內盡量避免震動儀器（例如離心機、旋渦振蕩器等）的使用，因為震動會使得積留在濾膜上的顆粒物質抖落，導致操作室內部潔凈度降低，同時如果在前操作面平衡失敗還會引起安全柜對操作者的污染。

　　

　　3、不同樣品柜內移動原則：柜內兩種及以上物品需要移動時，一定遵循低污染性物品向高污染性物品移動原則，避免污染性高的物品在移動過程中產生對柜體內部的大面積污染。明火使用原則：柜內盡量不要使用明火。因為在明火使用過程中產生的細小顆粒雜質將被帶入濾膜區域，這些高溫雜質會損傷濾膜。生物安全柜無法避免一定需要使用的時候，宜使用低火苗的本生燈。